Von 1472 bis 1488 war er Prior des Kölner Konvents und wurde dort 1480 zum Dekan der theologischen Fakultät berufen.

Ab 1481 war er Inquisitor in den Erzbistümern Mainz, Trier und Köln, ab Dezember 1484 auch in den Erzbistümern Salzburg und Bremen. 1474 gründete er die erste urkundlich bezeugte und in der Folgezeit größte deutsche Rosenkranzbruderschaft in Köln, der sogar Kaiser Friedrich III. und sein Sohn Maximilian I. angehörten. Er starb am 6. Dezember 1495 in Straßburg.

Traurige und bis in die heutige Zeit anhaltende Berühmtheit erlangte er als angeblicher Mitverfasser des berüchtigten "Hexenhammers" (veröffentlicht 1487 unter dem lateinischen Titel Malleus Maleficarum), der nach neueren Forschungen von seinem Ordensbruder Heinrich Institoris als alleinigem Autor geschrieben wurde. Offensichtlich benutzte Institoris den tadellosen Ruf Sprengers, um seinem Werk mehr Gewicht zu geben. Die dem Buch vorgestellte und ebenfalls Sprenger zugeschriebene Apologia beruht nach Aussage seines Sekretärs Servatius Vanckel auf einer Fälschung.

Beide, Sprenger und  Institoris, waren als Inquisitoren bestellt, deren Tätigkeit allerdings kaum mehr Bedeutung hatte. Sprenger wandte sich zwar gegen magische Praktiken, als Hexenverfolger trat er aber nicht in Erscheinung. Sprenger war auch der Gründer der Rosenkranzbruderschaft, der sogar Kaiser Friedrich III. und sein Sohn Maximilian I. angehörte. Er starb am 6. Dezember 1495 in Straßburg.